Collaborative Bioinformatics Laboratory

Hanoi - Ho Chi Minh City - Stuttgart

Khóa Huấn Luyện Tin Sinh Học Tại Việt Nam – Tháng 9/2006

English

Mục tiêu khóa học

Với nhiều công cụ phân tích và các cơ sở dữ liệu công cộng, tin sinh học (hay sinh học tính toán) ngày càng trở thành phương pháp hữu ích và đa năng trong công nghệ sinh học. Mục tiêu của khóa huấn luyện tin sinh học lần này là cung cấp cho các sinh viên cũng như các nhà nghiên cứu thuộc các lĩnh vực sinh học, công nghệ sinh học, sinh hóa những phương pháp hữu hiệu để thu nhận và phân tích thông tin từ các cơ sở dữ liệu sinh học, so sánh trình tự, xác định các motif, phân tích cấu trúc cũng như dự đoán những đặc tính từ trình tự và cấu trúc protein.

Khóa học, gồm lý thuyết + thực hành trên máy tính, được tổ chức theo cấp độ cơ bản, hướng đến đối tượng học viên là những sinh viên và người nghiên cứu chưa biết hoặc biết rất ít về các công cụ tin sinh học. Ngoài ra, còn có một buổi thảo luận (chuyên đề) dành cho các thành viên đã có kinh nghiệm nghiên cứu trong lĩnh vực tin sinh học.   

Đơn vị tài trợ

Ban tổ chức

PGS. TS. Trần Linh Thước
Khoa Sinh học
Trường ĐH Khoa học Tự nhiên TP.HCM

 

TS. Jürgen Pleiss
Viện Kỹ thuật Sinh hóa
Trường ĐH Stuttgart, CHLB Đức

TS. Hà Thanh Toàn
Viện nghiên cứu và phát triển Công nghệ Sinh học
Trường ĐH Cần Thơ

 

PGS. TS. Nguyễn Hoàng Lộc  
Trung tâm Tài nguyên và Môi trường
Trường ĐH
Huế

TS. Lê Việt Dũng
Trường ĐH Cần Thơ

   

Nơi tổ chức, thời gian tổ chức và đối tượng học viên

Khóa học được tổ chức tại Đại học Cần Thơ và Đại học Huế. Tại mỗi nơi, khóa học sẽ gồm 2 lớp cơ bản được tổ chức song song trong thời 3 ngày. Số học viên dự kiến cho mỗi lớp khoảng 25-30 người. Đối tượng có thể tham gia là sinh viên, học viên cao học, nghiên cứu sinh và nghiên cứu viên thuộc các ngành sinh học, công nghệ sinh học, công nghệ thông tin tại các Viện và Trường Đại học.

Thời gian tổ chức:

Tại Đại học Cần Thơ Tại Đại học Huế
ngày 7 đến ngày 9 tháng 9 năm 2006 ngày 12 đến ngày 14 tháng 9 năm 2006

 

Nội dung khóa học

Phần cơ bản Phần thảo luận chuyên đề

1. Giới thiệu chung về Tin - Sinh học

2. Khai thác các cơ sở dữ liệu sinh học

- Sử dụng một số cơ sở dữ liệu cơ bản

- Tìm kiếm tài nguyên thông tin khoa học

3. Phân tích trình tự sinh học

- So sánh trình tự, xác định vùng bảo tồn; phân tích motif và domain

- Ứng dụng thiết kế mồi cho PCR

4. Phân tích cấu trúc protein

- Thể hiện cấu trúc phân tử sinh học bằng các phần mềm Pymol, SPDBV

- Xác định các đặc tính cấu trúc

5. Dự đoán cấu trúc và chức năng protein từ trình tự

Xem chi tiết chương trình học

1. Lập trình Perl trong sinh học

2. Xây dựng một cơ sở dữ liệu sinh học

3. Protein modelling và protein docking

4. Ứng dụng mô phỏng động lực học phân tử trong nghiên cứu cấu trúc protein

 
Xem hướng dẫn tham gia thảo luận

Đăng ký

Các bạn quan tâm có thể đăng ký tham gia khóa học bằng cách tải phiếu đăng ký, điền các thông tin theo yêu cầu rồi gởi về  đại diện Ban Thư ký (xem phần liên lạc bên dưới). Do số lượng học viên mỗi lớp có hạn, khóa học sẽ ưu tiên các học viên đăng ký sớm và học viên có giấy giới thiệu của đơn vị nghiên cứu (Trường, Viện).

Lệ phí đăng ký: học viên tham gia khóa học không phải đóng lệ phí. Học viên ở xa tự túc kinh phí đi lại, ăn ở.

Thời hạn đăng ký: hết ngày 26 tháng 8 năm 2006

Liên lạc

Đăng ký tham gia khóa học cũng như cần giải đáp thắc mắc về khóa học, vui lòng liên lạc với đại diện Ban Thư ký:

  • Tại Cần Thơ:
    Anh Trần Nhâ
    n Dũng () 

  • Tại Huế:
    Anh Nguyễn Ngọc Lương (
    )

  • Liên lạc phần thảo luận chuyên đề:
    Anh Đỗ Anh Tuấn ()

 



Cập nhật ngày 29/07/2006